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Panel NGS "COLO-RECTAL 2": AKT1, ALK, BRAF, CTNNB1, EGFR, HER2, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, KIT, KRAS, MAP2K1, MET, NRAS, PDGFRA, PIK3CA, PTEN, SMAD4, STK11, TP53

Liste des examens

Code Eurofins Biomnis

COLO2

Synonymes

  • NGS
  • Oncologie
  • Thérapie ciblée
  • Test compagnon
  • Tumeur solide

Intérêt Clinique

L'approche panel NGS « COLO 2 » permet d'élargir le spectre des mutations recherchées aux gènes impliqués dans des mécanismes de résistance aux thérapies ciblées, à des marqueurs émergents pour une thérapie ciblée ou encore à des cibles moléculaires associées à une valeur pronostique. Il peut être aussi complété par une approche FISH ciblée et le test MSI.

Pré-analytique

  • Bloc tumoral inclus en paraffine ou lames(6 lames 5µm)ou ADN extrait.
  • T° ambiante

Informations complémentaires

  • Joindre le compte rendu anatomopathologique
  • Utiliser le bon de demande spécifique B9 : Biologie des Tumeurs Solides
  • Utiliser IMPERATIVEMENT l'enveloppe de transport S25

Matériel spécifique disponible

S25 : Enveloppe Génétique et Oncologie moléculaire

Documents à télécharger

Technique

Recherche de mutations sur un panel de gènes ciblés par technique de séquençage haut débit : Préparation de la librairie : AmpliSeq Library PLUS for Illumina Custom Panel V1- Enrichissement par amplicon -Séquençage : MiSeq Illumina - Flowcell:micro V2 (2x150pb)- Séquençage paired-end /Analyse bioinformatique : Miseq control Software version 2.6.2.1 / SeqOne Platform V1.2-CE version : SomaVar v1.4 CE

Délai

Maximum : 10 jours ( 1 semaine supplémentaire si vérification nécessaire par Sanger)

Cotation

  • 440.00 EUR non remboursable . RIHN : N452
Site réalisateur
Biomnis Lyon
Spécialité
Génétique
Contact(s)
Benoit QUILICHINI
Téléphone(s)
04 72 80 10 06

Légende

Température ambianteTempérature de conservation et de transport comprises entre +15°C et +25°C

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