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La coprologie fonctionnelle est un des éléments du diagnostic et du suivi de nombreuses maladies digestives et extra-digestives. Elle participe aussi au suivi thérapeutique, suivi chirurgical, suivi nutritionnel et évaluation des complications digestives de maladies systémiques.

La coprologie fonctionnelle permet une approche non invasive du fonctionnement de la sphère digestive réalisée sur la base d’explorations qualitatives (macro /microscopie) et quantitatives de prélèvement fécal. La coprologie fonctionnelle a un regain d’intérêt aujourd’hui grâce aux nouveaux biomarqueurs fécaux d’inflammation intestinale, d’insuffisance pancréatique exocrine, de défense immunitaire intestinale, de perméabilité intestinale et de dysbiose intestinale.

Les principales analyses sont :

  • La calprotectine (sur échantillon de selles) pour l’orientation diagnostique et le suivi des Maladies Inflammatoires Chroniques Intestinales (MICI). Un résultat positif oriente vers une atteinte organique de l’intestin (type maladie de Crohn ou RectoColite Hémorragique (RCH), permet d’évaluer le degré d’inflammation de la muqueuse intestinale, de suivre la réponse au traitement et surveiller le risque de rechute.
  • L’élastase fécale (sur échantillon de selles) pour le diagnostic des insuffisances pancréatiques exocrines dans des contextes de maldigestion d’origine pancréatique : pancréatite chronique, mucoviscidose, chirurgie pancréatique. Un résultat pathologique est complété par un examen microscopique des selles pour confirmer ou tempérer la notion de maldigestion.
  • Le fécalogramme (sur selles de 24h, 48h ou 72h) comprend un ensemble d’examens permettant d’évaluer le caractère organique ou fonctionnel des désordres digestifs. Il est composé de différentes analyses pouvant être demandées séparément :
    • L’examen physique des selles qui, en évaluant le débit fécal, le poids moyen et le pourcentage de poids sec, permet d’apprécier un état diarrhéique. Il est composé de :
      • un examen macroscopique,
      • un examen microscopique qui évalue l’état des composés glucidiques, lipidiques et protéiques des selles, définit le degré de digestion et d’absorption afin d’apprécier la capacité digestive gastrique, pancréatique et intestinale.
    • Le dosage des lipides avec calcul d’un débit lipidique (stéatorrhée),
    • Le dosage de l’azote total avec calcul d’un débit azoté (créatorrhée),
    • L’ionogramme fécal qui permet d’évaluer la fuite électrolytique et le calcul du trou osmotique qui permet de typer la diarrhée (motrice, sécrétoire ou osmotique),
    • L’examen chimique des selles (pH, acides organiques, ammoniaque, recherche de pigments biliaires, sang) qui estime d’état de la flore colique et la rapidité du transit intestinal.
  • La clairance de l’alpha1 antitrypsine (sur selles de 24h + sérum) pour le diagnostic des gastro-entéropathies exsudatives se caractérisant par une perte excessive de protéines plasmatiques dans le tube digestif entraînant un syndrome œdémateux.
  • La zonuline dont le dosage fécal permet une évaluation fiable et non invasive de l’état de l’hyperperméabilité intestinale. Elle est impliquée dans le fonctionnement des jonctions serrées entre les entérocytes de l’épithélium digestif.
  • La Beta2Défensine dont le dosage dans les selles renseigne sur le degré de protection des cellules épithéliales digestives grâce à son action antimicrobienne et sa participation à la régulation de l’équilibre du microbiote intestinal. Elle aurait également un rôle dans l’immunité intestinale.
  • Les IgA sécrétoires fécales pour l’appréciation de la défense des muqueuses intestinales dont elles tapissent la surface en prévenant la pénétration tissulaire des antigènes. Leur présence est un marqueur de la réponse inflammatoire, mais aussi immunitaire, de l’intestin (premier organe de défense immunitaire de l’organisme).

Rappel des principaux codes d’analyses :

  • Calprotectine fécale: CALP
  • Elastase fécale: ELASS
  • Fécalogramme : FECAP
  • Examen examen physique des selles : PHYSP
  • Examen chimique des selles CHISP
  • Dosage des lipides totaux des selles: STEAT
  • Dosage de l’azote total sur  des selles   : CRETO
  • Ionogramme avec calcul du trou osmotique des selles : IONSP
  • Apha 1 anti-trypsine des selles : A1TRS
  • Clairance fécale de l’alpha 1 anti-trypsine: CLALF
  • Zonuline : ZONUL
  • Béta2Défensine : BDEF2

Recommandations préanalytiques :

  • Le respect des conditions de recueil des selles :
    • La quantité minimale de selles à recueillir pour un échantillon.
    • La totalité des selles de 24h avec l’envoi groupé des selles de 48 ou 72h dans un même sachet pour la réalisation d’une seule analyse sur le pool de selles.
    • L’emploi des pots adaptés pour la bonne étanchéité du recueil.
  • Les fiches de renseignements cliniques doivent être utilisées afin d’apporter les éléments nécessaires à une bonne interprétation du biologiste. Elles se trouvent sur le référentiel des examens en ligne, liées à chaque paramètre concerné.