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Panel NGS "COLO-RECTAL 1" : KRAS, NRAS, BRAF

Liste des examens

Code Eurofins Biomnis

COLO1

Synonymes

  • NGS
  • Oncologie
  • Test compagnon
  • Thérapie ciblée
  • Tumeur solide

Intérêt Clinique

L'approche panel NGS « COLO 1 » répond aux attentes, en routine, du clinicien pour la prescription de thérapies ciblées dans le cadre du cancer colo-rectal métastatique. Les statuts KRAS, NRAS et récemment BRAF permettent de guider le choix d'une thérapie ciblée (Ac monoclonal anti-EGFR et Ac anti-BRAF). Le test MSI et les FISH unitaires COLON complètent cette offre.

Pré-analytique

  • Bloc tumoral inclus en paraffine ou lames(6 lames 5µm)ou ADN extrait.
  • T° ambiante

Informations complémentaires

  • Joindre le compte rendu anatomopathologique
  • Utiliser le bon de demande spécifique B9 : Biologie des Tumeurs Solides
  • Utiliser IMPERATIVEMENT l'enveloppe de transport S25

Matériel spécifique disponible

S25 : Enveloppe Génétique et Oncologie moléculaire


Technique

Recherche de mutations sur un panel de gènes ciblés par technique de séquençage haut débit : Préparation de la librairie : AmpliSeq Library PLUS for Illumina Custom Panel V1- Enrichissement par amplicon -Séquençage : MiSeq Illumina - Flowcell:micro V2 (2x150pb)- Séquençage paired-end /Analyse bioinformatique : Miseq control Software version 2.6.2.1 / SeqOne Platform V1.2-CE version : SomaVar v1.4 CE

Délai

10 jours ( 1 semaine supplémentaire si vérification nécessaire par Sanger)


Site réalisateur
Biomnis Lyon
Spécialité
Génétique
Contact(s)
Dr Benoit QUILICHINI
Téléphone(s)
+334 72 80 10 06

Légende

Température ambianteTempérature de conservation et de transport comprises entre +15°C et +25°C