Infectiologie – Eurofins Biomnis

Les 5 pôles d’excellence en infectiologie d’Eurofins Biomnis :

L’utilisation de technologies de pointe est indispensable dans ce département pour permettre l’adaptation à la constante évolution du diagnostic des maladies infectieuses : épidémies, émergence de nouveaux agents pathogènes, apparition de résistance aux anti-infectieux.

Document
B3-INTFR - Bon de demande : Diagnostic anténatal
Document
D31-INTFR – Information et consentement de la femme enceinte à la réalisation du prélèvement et d’un ou de plusieurs examens à visée de diagnostic prénatal in utero
Document
D43-INTFR - Attestation - Consentement en vue d'un examen des caractéristiques génétiques d'une personne
Document
D44-INTFR - Information et Consentement de la femme enceinte / Information et Consentement en vue d'un examen des caractéristiques génétiques d'une personne
Document
K13P-INTFR – Renseignements cliniques : PCR Coqueluche
Document
R12-INTFR – Renseignements cliniques : Diagnostic de mycobactéries
Document
R28-INTFR – Renseignements cliniques : Dengue / Chikungunya / Zika
Document
R35-INTFR – Infectiologie
Publication
Characterization of Samples Identified as Hepatitis C Virus Genotype 1 without Subtype by Abbott RealTime HCV Genotype II Assay Using the New Abbott HCV Genotype Plus RUO Test
Mokhtari C, Ebel A, Reinhardt B, Merlin S, Proust S, Roque-Afonso AM J Clin Microbiol 2016 ; 54:296-299
Publication
Chronic hepatitis E in absence of severe immune deficiency
Colson P, Schleinitz N, Vely F, Poveda JD, Jacomo V, Demerle C, Borentain P, Gerolami R.Colson P, et al. Clin Res Hepatol Gastroenterol. 2020 Feb;44(1):e1-e4. doi: 10.1016/j.clinre.2019.06.015. Epub 2019 Jul 18 - PMID: 31327621
Publication
Combined Genotypic, Phylogenetic, and Epidemiologic Analyses of Mycobacterium tuberculosis Genetic Diversity in the Rhône Alpes Region, France
Pichat C, Couvin D, Carret G, Frédénucci I, Jacomo V, Carricajo A, Boisset S, Dumitrescu O, Flandrois JP, LinaG, Rastogin N Plos One 2016
Publication
Comparative performance of three rapid HBsAg assays for detection of HBs diagnostic escape mutants in clinical samples
Servant-Delmas A, Ly TD, Hamon C, Kassim Houdah A, Laperche S J Clin Microbiol 2015 ; 53:3954-3955
Publication
Early assessment of diffusion and possible expansion of SARS-CoV-2 Lineage 20I/501Y.V1 (B.1.1.7, variant of concern 202012/01) in France
Alexandre Gaymard, Paolo Bosetti, Adeline Feri, Gregory Destras, Vincent Enouf, Alessio Andronico, Sonia Burrel, Sylvie Behillil, Claire Sauvage, Antonin Bal, Florence Morfin, Sylvie Van Der Werf, Laurence Josset, ANRS MIE AC43 COVID-198, French viro COVID group (including Catherine Coignard), François Blanquart, Bruno Coignard, Simon Cauchemez, Bruno Lina Eurosurveillance 04/03/2021 - Volume 26, Issue 9
Publication
Émergence de la leptospirose humaine en France métropolitaine ? Actualités sur la surveillance
Bourhy P, Picardeau M, Septfons A, Trombert S, Cart-Tanneur E Med Mal Infect 2017 ; 47 (4s):s150
Publication
Evaluation of the performance of a new automated HIV combination assay
Ghisetti V, Coignard C, Allice T, Ly TD J Clin Virol 2017 ; 96:80-83
Publication
Evaluation of the SLOMYCO Sensititre® panel for testing the antimicrobial susceptibility of Mycobacterium marinum isolates
Chazel M, Marchandin H, Keck N, Terru D, Carrière C, Ponsoda M, Jacomo V, Panteix G, Bouzinbi N, Bañuls AL, Choisy M, Solassol J, Aubry, Godreuil S Ann Clin Microbiol Antimicrob 2016 ; 15:30
Publication
Large outbreak of urogenital schistosomiasis acquired in Southern Corsica: monitoring the early signs of the endemicization?
Noël H, Ruello M, Maccary A, Pellat C, Sommen C, Boissier J, Barré-Cardi H, Fillaux J, Termignon JL, Debruyne M, Chyderiotis G, Durand J, Ramalli L, Chiappini JD , Malfait P, Berry Clin Microbiol Infect 2017 ; pii: S1198-743X(17)30350-6. doi: 10.1016/j.cmi
Publication
Performance of HBsAg quantification assays for detection of Hepatitis B virus genotypes and diagnostic escape-variants in clinical samples
Thibault V, Servant-Delmas A, Ly TD, Roque-Afonso AM, Laperche S J Clin Virol 2017 ; 89:14-21
Publication
Persistence of Zika virus in gradient sperm preparation
Cassuto NG, Marras G, Jacomo V, Bouret D J Gynecol Obstet Hum Reprod 2018, pii: S2468-7847(18)30038-2
Publication
Preliminary report of an autochthonous Chikungunya outbreak in France, July to September 2017
Calba C, Guerbois-Galla M, Franke F, Jeannin C, Auzet-Caillaud M, Grard G, Pigaglio L, Decoppet A, Weicherding J, Savaill MC, Munoz-Riviero M, Chaud P, Cadiou B, Ramalli L, Fournier P, Noel H, De Lamballerie X, Paty MC, Leparc-Goffart I Euro Surveill 2017 ; 22(39):pii=17-00647
Publication
Prevalence of SARS-CoV-2 antibodies in France: results from nationwide serological surveillance
Stéphane Le Vu, Gabrielle Jones, François Anna, Thierry Rose, Jean-Baptiste Richard, Sibylle Bernard-Stoecklin, Sophie Goyard, Caroline Demeret, Olivier Helynck, Nicolas Escriou, Marion Gransagne, Stéphane Petres, Corinne Robin, Virgile Monnet, Louise Perrin de Facci, Marie-Noelle Ungeheuer, Lucie Léon, Yvonnick Guillois, Laurent Filleul, Pierre Charneau, Daniel Lévy-Bruhl, Sylvie van der Werf & Harold Noel  Nature Communications volume 21/05/2021 12, Article number: 3025 (2021)
Publication
Prospective Whole-Genome Sequencing in Tuberculosis Outbreak Investigation, France, 2017-2018
Genestet C, Tatai C, Berland JL, Claude JB, Westeel E, Hodille E, Fredenucci I, Rasigade JP, Ponsoda M, Jacomo V, Vachée A, Gaudart A, Gaillard JL, Roux AL, Ader F, Tararbit K, Terpant G, Bryant JE, Lina G, Dumitrescu O; Lyon TB Study Group.Genestet C, et al. Emerg Infect Dis. 2019 Mar;25(3):589-592. doi: 10.3201/eid2503.181124 - PMID: 30789329
Publication
Routine survey of Mycobacterium tuberculosis isolates reveals nosocomial transmission.
Genestet C, Paret R, Pichat C, Berland JL, Jacomo V, Carret G, Fredenucci I, Hodille E, Rasigade JP, Boisset S, Carricajo A, Lina G, Ronnaux-Baron AS, Mornex JF, Grando J, Sénéchal A, Ader F, Dumitrescu O; Lyon TB study group.Genestet C, et al. Eur Respir J. 2020 Mar 20;55(3):1901888. doi: 10.1183/13993003.01888-2019. Print 2020 Mar
Publication
Surveillance des infections humaines par hantavirus en France métropolitaine, 2012-2016
Reynes JM, Carli D, Renaudin B, Fizet A, Bour JB, Brodard V, Cart-Tanneur E, Dewilde A, El Hamri M, Fleury H, Hecquet D, Jeulin H, Lechat S, Lemarquand-Bardini M, Lepiller Q, Poveda JD, Raulin O, Twizeyimana E, Van Cauteren D, Velay A, Septfons A, Baize S BEH 2017 ; 23:492-499
Publication
Surveillance du chikungunya et de la dengue en France métropolitaine, 2014
Septfons A, Noël H, Leparc-Goffart I, Giron S, Delisle E, Chappert JL, Catelinois O, Franke F, Servas V, Guinard A, Debruyne M, Schaal O, Brichler S, Ninove L, Prat C, Flusin O, Poujol I, Letort MJ, Deniau J, Six C, Rousseau C, De Valk H, Paty MC Les Feuillets de Biologie 2016 ; 330:70-77
Publication
Surveillance du chikungunya, de la dengue et des infections à virus Zika en France métropolitaine, 2017
Fournet N, Franke F, Chaud P, Raguenaud ME, Calba C, Septfons A, Cart-Tanneur E. et al. Bull Epidémiol Hebd. 2018;(24):494-503.
Publication
The ROMANOV study found impaired humoral and cellular immune responses to SARS-CoV-2 mRNA vaccine in virus-unexposed patients receiving maintenance hemodialysis
Maxime Espi, Xavier Charmetant, Thomas Barba, Laetitia Koppe, Caroline Pelletier, Emilie Kalbacher, Elodie Chalencon, Virginie Mathias, Anne Ovize, Emmanuelle Cart-Tanneur, Christine Bouz, Laurence Pellegrina, Emmanuel Morelon, Denis Fouque, Laurent Juillard, Olivier Thaunat Kidney International 2021 Oct;100(4):928-936. doi: 10.1016/j.kint.2021.07.005.
Publication
Vector-borne Transmission of Zika Virus in Europe, Southern France, August 2019
Sandra Giron, Florian Franke, Anne Decoppet, Bernard Cadiou, Thierry Travaglini, Laurence Thirion, Guillaume Durand, Charles Jeannin, Grégory L’Ambert, Gilda Grard, Harold Noël, Nelly Fournet, Michelle Auzet-Caillaud, Christine Zandotti, Samer Aboukaïs, Pascal Chaud, Saby Guedj, Lakri Hamouda, Xavier Naudot, Anne Ovize, Clément Lazarus, Henriette de Valk, Marie-Claire Paty, Isabelle Leparc-Goffart Euro Surveill. 2019 Nov;24(45):1900655.
Poster
12ème Congrès de la Société Française de Microbiologie, Paris, mars 22-23, 2016
Les Liquides Céphalo-Rachidiens : conservation pré-analytique à+ 4 °C ou – 20 °C ? Jacomo V, Schaal O, Fournier P
Poster
17èmes Journées Francophones de Virologie, Paris, avril 9, 2015
Résolution des échecs de génotypage de la technique Abbott RealTime HCV Genotype II par un test temps réel additionnel Mokhtari C, Ebel A, Reinhardt B, Merlin S, Proust S, Roque-Afonso AM
Poster
18th Annual Meeting of the European Society for Clinical Virology, Edinburgh, September 9-12, 2015
Evaluation of a new high sensitive, qualitative and quantitative Hepatitis B surface antigen assay Ly TD, Coignard C
Poster
18th Annual Meeting of the European Society for Clinical Virology, Edinburgh, September 9-12, 2015 - 1
Characterization of samples with genotype 1 without subtype results by Abbott RealTime HCV genotype II using the new Abbott HCV Genotype Plus RUO test Mokhtari C, Ebel A, Reinhardt B, Merlin S, Proust S, Roque-Afonso AM
Poster
21st Annual European Society for Clinical Virology (ESCV) meeting, Athens 23 - 26 September 2018
Performance Evaluation of the Aptima® HIV-1 Quant Dx and Aptima® HBV Quant assays on the fully automated Panther in comparison to Cobas® 6800/8800 HIV-1 and HBV tests A. Ebel, C. Bali, L. Guis, S. Merlin
Poster
25th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Copenhagen, April 25-28, 2015
Evaluation of three fully automated assays for the detection of cytomegalovirus IgM and IgG: DiaSorin LIAISON® XL, Abbott Architect ® and Roche Cobas 6000® Bouthry E, Ly TD, Vauloup-Fellous C
Poster
27th ECCMID, Vienna Austria, April 22-25, 2017
Strain-specific estimation of epidemic success provides insights into the transmission dynamics of tuberculosis Rasigade JP, Barbier M, Dumitrescu O, Pichat C, Carret G, Ronnaux-Baron AS, Blasquez G, Godin-Benhaim C, Boisset S, Carricajo A, Jacomo V, Fredenucci I, Pérouse de Montclos M, Flandrois JP, Ader F, Supply P, Lina G, Wirth T
Poster
29th IUSTI European Conference on Sexually Transmitted Infections, Sitges (Barcelona), 24-26 September, 2015
Prevalence of Mycoplasma genitalium in France and comparison with Chlamydia trachomatis and Neisseria gonorrhoeae as determined by the Mycoplasma genitalium TMA assay Ebel A, Venard C, Brunengo D, Merlin S
Poster
36ème RICAI, Paris, décembre 12-13, 2016 - 1
Borréliose et index de synthèse intrathécale : bilan biologique rétrospectif de l’année 2015 Coignard C, Ly TD
Poster
36ème RICAI, Paris, décembre 12-13, 2016 - 2
Evaluation des performances de la trousse Aptima® HBV Quant (Hologic) Ebel A, Bali C, Guis L, Merlin S
Poster
37ème RICAI, Paris, décembre 18-19, 2017
Confirmation VIH : données biologiques et épidémiologiques des 3 dernières années dans un laboratoire de biologie spécialisée Coignard C, Ly TD
Poster
38e RICAI, Paris 17-18 décembre 2018
Epidémie de rougeole 2018 : le sérodiagnostic un marqueur simple et performant. T.D. Ly, C. Coignard
Poster
3e Journée Francophone de Biologie Médicale, Monaco, 6-7-8 novembre 2019
Dépistage systématique de Neisseria gonorrhoeae et de C. trachomatis par test d’amplification génique : bilan d’une année d’expérience L. Mine, L. Guis, S. Merlin, A. Ebel
Poster
Congrès SFP / SFMM, Toulouse, mars 29-31, 2017
Apport de 2 tests de dépistage pour le diagnostic de la bilharziose et place du Western blot Chydériotis G, Cart-Tanneur E, Lecuelle C, Félix MH
Poster
ESCAIDE 2015, Stockholm, November 11-13, 2015
Re-emergence of urinary schistosomiasis in Europe ? Infections acquired in Southern Corsica – Investigation of a cluster of Schistosoma haematobium infections in 2014 Ramalli L, Noël H, Ruello M, Maccary A, Boissier J, Barré-Cardi H, Fillaux J, Termignon JL, Debruyne M, Chyderiotis G, Denoyel GA, Succo T, Armengaud A, Paty MC, Heuzé G, Mattei J, Théron A, Berry A
Poster
EuroMedLab, Paris, June 22-24, 2015
Early Performance Evaluation of cobas® HBV, cobas® HCV and cobas® HIV-1Quantitative Nucleic Acid Tests for use on the new cobas® 6800/8800 Systems Ebel A, Merlin S, Marins ED G, Canchola J, Njoya M, Simon CO
Poster
FIBA 2016, Dakar, January 13-14, 2016
ANCA associated HIV infection in Senegal: a serological trap Arouna O, Niang A, Abiola A, Guis L, Le Flem L, Diene JF, Mboup S
Poster
Fort Collins (USA), May 31-June 3, 2016
Seoul Virus Infection in Human, France, 2014-2016 Reynes JM, Carli D, Bour JB, Boudjeltia S, Dewilde A, Gerbier G, Nussbaumer T, Jacomo V, Rapt MP, Septfons A, Rollin PE
Poster
Journées Nationales d'Infectiologie, Nantes, 13-15 juin, 2018
Infections à Chlamydia trachomatis : données épidémiologiques récentes dans un laboratoire spécialisé Ebel A, Guis L, Merlin S
Poster
RICAI 2019, Paris, 16-17 décembre 2019
Evaluation of the BioPlex 2200 Lyme IgG/IgM immunoassay system C. Coignard, C. Clément-Vincent, Td. Ly, A. L’hotellier
Poster
RICAI 2019, Paris, 16-17 décembre 2019 - 1
Spécificité de la sérologie chikungunya et surveillance épidémiologique C. Calba, F. Franke, E. Brottet, G. Terpant, N. Fournet, A. Ovize, J.D. Poveda, I. Leparc-Goffart, M.C. Paty

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