Panel Infectieux - Gastro-intestinal - diagnostic direct - PCR

Code Eurofins Biomnis

GIP

Synonymes

• Plesiomonas shigelloides
• Shiga-like toxin-producing E. coli (STEC) stx1/stx2
• Vibrio cholerae
• Vibrio (V. parahaemolyticus/V. vulnificus/ V. cholerae)
• Cryptosporidium spp.
• Enteroaggregative E. coli (EAEC)
• Cyclospora cayetanensis
• Shigella/Enteroinvasive E. coli (EIEC)
• E. coli O157:H7
• Sapovirus GI/GII/GIV/GV
• Adenovirus F 40/41
• Enteropathogenic E. coli (EPEC)
• Yersinia enterocolitica
• Salmonella sp
• Clostridium difficile : toxines A/B
• Amibes
• Rotavirus A
• Norovirus GI/GII
• Enterotoxigenic E. coli (ETEC) lt/st
• Astrovirus/Sapovirus
• Astrovirus
• Giardia intestinalis
• Campylobacter (C. jejuni/coli/upsaliensis)
• Entamoeba histolytica

Intérêt Clinique

La symptomatologie des infections gastro-intestinales est peu spécifique, et ne permet pas de s'orienter vers un pathogène précis. Les pathogènes responsables de signes digestifs sont très nombreux, et peuvent être: virus, bactéries (ou toxines de bactéries), ou même parasites. Les techniques actuelles de biologie médicale pour le diagnostic de ces infections gastro-intestinales sont très différentes en fonction de l¿orientation microbiologique (virus, bactéries, parasites), et ont des sensibilités et des spécificités elles-aussi très différentes. Ceci explique que la documentation microbiologique précise des infections gastro-intestinales est peu fréquente.
De plus, certaines recherches microbiologiques relèvent de l'urgence médicale (toxines d'E. coli entérohémorragique, ou clone d'E. coli O157:H7 par exemple, responsables de Syndrome Hémolytique et Urémique chez l'enfant), mais sont des analyses longues et lourdes en pratique.

L'utilisation du panel de PCR gastro-intestinales permet de s'affranchir de ces nombreux problèmes, et donc :
- d'avoir une documentation microbiologique précise, avec une recherche simultanée des 32 pathogènes les plus fréquemment incriminés
- d'avoir un résultat en quelques heures seulement, à partir d¿un unique prélèvement de selles, et après une seule et unique technique d'une heure approximativement.

La prise en charge du patient sera ensuite rapide et efficace car adaptée au pathogène isolé, tout en limitant l'utilisation inadéquate d'antibiotiques.
Ce panel gastro-intestinal comprend les 32 cibles suivantes :
- Campylobacter (C. jejuni/coli/upsaliensis)
- Clostridium difficile : toxines A/B
- Plesiomonas shigelloides
- Salmonella sp
- Vibrio (V. parahaemolyticus/V. vulnificus/ V. cholerae),
- Vibrio cholerae
- Yersinia enterocolitica
Diarrheagenic E. coli/Shigella
- Enteroaggregative E. coli (EAEC)
- Enteropathogenic E. coli (EPEC)
- Enterotoxigenic E. coli (ETEC) lt/st
- Shiga-like toxin-producing E. coli (STEC) stx1/stx2
- E. coli O157:H7
- Shigella/Enteroinvasive E. coli (EIEC)
Parasites
- Cryptosporidium sp
- Cyclospora cayetanensis
- Entamoeba histolytica
- Giardia intestinalis
Virus
- Adenovirus F 40/41
- Astrovirus
- Norovirus GI/GII
- Rotavirus A
- Sapovirus

Pré-analytique

• Selles
• Réfrigéré

Informations complémentaires

Matériel spécifique disponible

S14 : Sachets VIOLET de transport pour PCR agents infectieux, cultures de virus, mycobactéries

Technique

PCR temps réel

Délai

2 jours

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