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Panel NGS "Poumon 1": EGFR, BRAF, MET, KRAS

Liste des examens

Code Eurofins Biomnis

POUM1

Synonymes

  • Tumeur solide
  • NGS
  • Test compagnon
  • Thérapie ciblée
  • Oncologie

Intérêt Clinique

L'approche panel NGS « POUM1 » associée à l'approche FISH ciblée unitaire répond aux attentes, en routine, du clinicien pour la prescription de thérapies ciblées dans le cadre du CBNPC localement avancé ou métastatique. En 2020, les statuts EGFR (mutation) , ALK (réarrangement) , ROS1 (réarrangement) , RET (réarrangement), BRAF (mutation), NTRK (réarrangement) et MET (mutation) permettent de guider le choix d'une thérapie ciblée (AMM ou ATU). Le statut KRAS complète ce panel.

Pré-analytique

  • Bloc tumoral inclus en paraffine ou lames(6 lames 5µm)ou ADN extrait.
  • T° ambiante

Informations complémentaires

  • Joindre le compte rendu anatomopathologique
  • Utiliser le bon de demande spécifique B9 : Biologie des Tumeurs Solides
  • Utiliser IMPERATIVEMENT l'enveloppe de transport S25

Matériel spécifique disponible

S25 : Enveloppe Génétique et Oncologie moléculaire


Technique

Recherche de mutations sur un panel de gènes ciblés par technique de séquençage haut débit : Préparation de la librairie : AmpliSeq Library PLUS for Illumina Custom Panel V1- Enrichissement par amplicon -Séquençage : MiSeq Illumina - Flowcell:micro V2 (2x150pb)- Séquençage paired-end /Analyse bioinformatique : Miseq control Software version 2.6.2.1 / SeqOne Platform V1.2-CE version : SomaVar v1.4 CE

Délai

10 jours ( 1 semaine supplémentaire si vérification nécessaire par Sanger)


Site réalisateur
Biomnis Lyon
Spécialité
Génétique
Contact(s)
Dr Benoit QUILICHINI
Téléphone(s)
+334 72 80 10 06

Légende

Température ambianteTempérature de conservation et de transport comprises entre +15°C et +25°C

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