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Définition, prévalence et modalités de détection des variants du SARS-CoV-2 en France


Santé publique France a fait un point sur la circulation des variants en France au 14 avril 21 (1).

La surveillance mise en place par Santé Publique France, en lien avec le CNR des infections respiratoires, permet de mieux connaître la circulation globale des variants du SARS-CoV-2 sur notre territoire, et ainsi d’appréhender les risques associés à leur diffusion en termes de transmissibilité, de sévérité de l’infection ou d’échappement immunitaire.

Classement des variants (d’après 1)

Depuis le 20 avril dernier, Eurofins Biomnis utilise en technique de criblage, le nouveau kit de RT-PCR GSD
NovaType II SARS-CoV-2, développé par la société Novatec Immundiagnostica GmbH, qui permet de détecter les mutations N501Y et E484K, communes aux 4 variants préoccupants (VOC), et la mutation K417N, propre au variant B.1.351 (« Afrique du Sud »).
En pratique, il est désormais possible d’identifier le variant sud-africain et de suspecter le variant brésilien. Les échantillons suspects sont adressés à l’une des quatre plateformes nationales de séquençage pour confirmation.

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Références

(1) https://www.santepubliquefrance.fr/dossiers/coronavirus-covid-19/coronavirus-circulation-des-variants-du-sars-cov-2
(2) https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20210225_weekly_epi_update_voc-special-edition.pdf?sfvrsn=1eacfa47_7&download=true%20