Panel NGS tumeur solide Endomètre: BRCA1, BRCA2, POLE, TP53 somatiques

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Code Eurofins Biomnis

ENDON

Spécialité

Génétique


Intérêt Clinique

Ce panel NGS destiné à l'analyse moléculaire des cancers de l'endomètre inclut les gènes BRCA1, BRCA2, TP53 et POLE, dont la caractérisation contribue à la classification moléculaire des tumeurs et oriente le pronostic ainsi que les options thérapeutiques. Les tumeurs mutées dans le gène TP53 correspondent à un sous¿groupe à haut risque, tandis que les tumeurs POLE mutées définissent un sous¿groupe ultramuté à excellent pronostic. Enfin, les altérations des gènes BRCA1 et BRCA2 peuvent orienter vers un traitement par inhibiteurs de PARP.

Pré-analytique
  • Bloc tumoral inclus en paraffine ou lames(6 lames 5µm) ou ADN extrait ou copeaux (6 copeaux de 5 µm)
  •   T° ambiante
  • Aliquot spécifique pour cette analyse :  : Non
Informations complémentaires

Utiliser le bon de demande spécifique B9 : Biologie des Tumeurs Solides
Utiliser IMPERATIVEMENT l'enveloppe de transport S25
Joindre le compte rendu anatomopathologique

Matériel spécifique disponible
  • S25 : Enveloppe Génétique et Oncologie moléculaire

Technique

Recherche de variants sur un panel de gènes ciblés par séquençage haut-débit. - Préparation de la librairie Kit 2.0 Twist avec UMI et enrichissement par capture - Séquençage  NovaSeq Illumina (2x150pb) - Analyse bioinformatique : Demultiplexage BCLconvert / SeqOne SomaVar. - Seuil de détection théorique : 5% - Profondeur minimale : 99% de couverture à 200X (après analyse des UMI) - Version du génome : GRCh38

Délai

14 jours

Cotation
  • Nous consulter. N453
  • Référence RIHN : N453

Site réalisateur

Biomnis Lyon

Contact(s)

Légende

T° ambianteTempérature de conservation et de transport comprise entre +15°C et +25°C