Panel NGS tumeur solide - PAN : AKT1 - ALK - AR - ATM - BARD1 - BRAF - BRCA1 - BRCA2 - BRIP1 - CDK12 - CDK4 - CDK6 - CDKN2A - CHEK1 - CHEK2 - CTNNB1 - DDR2 - EGFR - ERBB2 - ESR1 - EZH2 - FANCA - FANCL - FBXW7 - FGFR1 - FGFR2 - FGFR3 - FOXL2 - GNA11 - GNAQ - GNAS - HRAS - IDH1 - IDH2 - JAK2 - KEAP1 - KIT - KRAS - MAP2K1 - MET - MLH1 - MRE11 - NBN - NRAS - NTRK1 - PALB2 - PDGFRA - PIK3CA - POLE - PPP2R2A - PTEN - RAD51B - RAD51C - RAD51D - RAD54L - RAF1 - RB1 - RET - ROS1 - SF3B1 - SMAD4 - STK11 - TERT - TP53
Retour à la listeCode Eurofins Biomnis
PAN
Synonymes
- NGS
- Oncologie
- Test compagnon
- Thérapie ciblée
- Tumeur solide
Spécialité
Génétique
Pré-analytique
- Bloc tumoral inclus en paraffine ou lames(6 lames 5µm) ou ADN extrait ou copeaux (6 copeaux de 5 µm)
- T° ambiante
- Aliquot spécifique pour cette analyse : : Non
Informations complémentaires
Utiliser le bon de demande spécifique B9 : Biologie des Tumeurs Solides
Utiliser IMPERATIVEMENT l'enveloppe de transport S25
Joindre le compte rendu anatomopathologique
Matériel spécifique disponible
- S25 : Enveloppe Génétique et Oncologie moléculaire
Documents à télécharger
Technique
Recherche de variants sur un panel de gènes ciblés par technique de séquençage haut-débit (SHD). - Préparation de la librairie : Library Preparation Enzymatic Fragmentation Kit 2.0 Twist avec UMI - Enrichissement par capture (panel à façon) - Séquençage : NovaSeq Illumina (2x150pb) - Analyse bioinformatique : Demultiplexage BCLconvert / SeqOne SomaVar v2.7 RUO - Seuil de détection théorique : 5% - Profondeur minimale : 99% de couverture à 200X (après analyse des UMI) pour les gènes de Niveau I et II de l'indication concerné selon les recommandations ESMO 2024 (PMID: 38834388). >95% de couverture à 200X pour tous les autres gènes. - Version du génome : GRCh38
Délai
15 jours
Cotation
- 750.00 EUR non remboursable . RIHN : N453
- Référence RIHN : N453
Biomnis Lyon
Légende
T° ambianteTempérature de conservation et de transport comprise entre +15°C et +25°C
