Panel NGS tumeur solide Sein: AKT1, BRCA1, BRCA2, ESR, HER2, PIK3CA et PTEN somatiques
Retour à la listeCode Eurofins Biomnis
SEIN
Spécialité
Génétique
Intérêt Clinique
Ce panel NGS identifie des altérations théranostiques clés dans les cancers du sein¿: les mutations des gènes BRCA1/2 orientent vers les inhibiteurs de PARP¿; les mutations PIK3CA permettent l'accès aux inhibiteurs de PI3Kalpha¿; les mutations ESR1 signalent une résistance aux inhibiteurs de l'aromatase ; les mutations ERBB2 peuvent rendre éligible à des thérapies d'anticorps monoclonaux anti¿HER2 ciblant les tumeurs HER2¿mutées enfin les altérations AKT1 et PTEN reflètent une activation de la voie PI3K/AKT et peuvent influencer les choix thérapeutiques ou l'inclusion en essai clinique.
Pré-analytique
- Bloc tumoral inclus en paraffine ou lames(6 lames 5µm) ou ADN extrait ou copeaux (6 copeaux de 5 µm)
- T° ambiante
- Aliquot spécifique pour cette analyse : : Non
Informations complémentaires
Utiliser le bon de demande spécifique B9 : Biologie des Tumeurs Solides
Utiliser IMPERATIVEMENT l'enveloppe de transport S25
Joindre le compte rendu anatomopathologique
Matériel spécifique disponible
- S25 : Enveloppe Génétique et Oncologie moléculaire
Documents à télécharger
Technique
Recherche de variants sur un panel de gènes ciblés par séquençage haut-débit. - Préparation de la librairie Kit 2.0 Twist avec UMI et enrichissement par capture - Séquençage NovaSeq Illumina (2x150pb) - Analyse bioinformatique : Demultiplexage BCLconvert / SeqOne SomaVar. - Seuil de détection théorique : 5% - Profondeur minimale : 99% de couverture à 200X (après analyse des UMI) - Version du génome : GRCh38
Délai
14 jours
Cotation
- Nous consulter. N453
- Référence RIHN : N453
Biomnis Lyon
Légende
T° ambianteTempérature de conservation et de transport comprise entre +15°C et +25°C