Panel NGS tumeur solide Sein: AKT1, BRCA1, BRCA2, ESR, HER2, PIK3CA et PTEN somatiques

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Code Eurofins Biomnis

SEIN

Spécialité

Génétique


Intérêt Clinique

Ce panel NGS identifie des altérations théranostiques clés dans les cancers du sein¿: les mutations des gènes BRCA1/2 orientent vers les inhibiteurs de PARP¿; les mutations PIK3CA permettent l'accès aux inhibiteurs de PI3Kalpha¿; les mutations ESR1 signalent une résistance aux inhibiteurs de l'aromatase ; les mutations ERBB2 peuvent rendre éligible à des thérapies d'anticorps monoclonaux anti¿HER2 ciblant les tumeurs HER2¿mutées enfin les altérations AKT1 et PTEN reflètent une activation de la voie PI3K/AKT et peuvent influencer les choix thérapeutiques ou l'inclusion en essai clinique.

Pré-analytique
  • Bloc tumoral inclus en paraffine ou lames(6 lames 5µm) ou ADN extrait ou copeaux (6 copeaux de 5 µm)
  •   T° ambiante
  • Aliquot spécifique pour cette analyse :  : Non
Informations complémentaires

Utiliser le bon de demande spécifique B9 : Biologie des Tumeurs Solides
Utiliser IMPERATIVEMENT l'enveloppe de transport S25
Joindre le compte rendu anatomopathologique

Matériel spécifique disponible
  • S25 : Enveloppe Génétique et Oncologie moléculaire

Technique

Recherche de variants sur un panel de gènes ciblés par séquençage haut-débit. - Préparation de la librairie Kit 2.0 Twist avec UMI et enrichissement par capture - Séquençage  NovaSeq Illumina (2x150pb) - Analyse bioinformatique : Demultiplexage BCLconvert / SeqOne SomaVar. - Seuil de détection théorique : 5% - Profondeur minimale : 99% de couverture à 200X (après analyse des UMI) - Version du génome : GRCh38

Délai

14 jours

Cotation
  • Nous consulter. N453
  • Référence RIHN : N453

Site réalisateur

Biomnis Lyon

Contact(s)

Légende

T° ambianteTempérature de conservation et de transport comprise entre +15°C et +25°C