Le virus Zika est un Flavivirus enveloppé à ARN simple brin, dont il existe 2 lignages : un lignage Afrique (avec 2 sous-lignages) et un lignage Asie.
Isolé la première fois en 1947 d’un singe en Ouganda (forêt Zika d’où il tire son nom), puis chez l’homme en 1952 (Ouganda, Tanzanie), il circule en Afrique et en Asie depuis longtemps.
Des épidémies sont survenues en Micronésie (2007), Polynésie française (2013), Nouvelle Calédonie (2014). Comme pour la dengue et le Chikungunya, le virus est principalement transmis par un moustique du genre Aedes. Outre la transmission vectorielle, une transmission sexuelle, périnatale et par transfusion sanguine a été décrite.
Selon les données du CNR Arbovirus (2019), la séroprévalence du virus Zika en Guyane a été estimée à 23,3 % (20,9 – 25,9), avec de larges variations selon les communes ; mais aucun cas aux Antilles en 2018 ni 2019. En 2019, 3 cas ont été détectés en métropole (Hyères, 83) ; en 2022, 6 cas ont été notifiés (0 en 2023 en France métropolitaine du 1e mai au 2 juin).
